1. Caractérisation des modifications de la chromatine dans les cellules de type tumorales induites après l’infection par A. tumefaciens sauvage

Nous utilisons des méthodes de microscopie à haute résolution pour suivre la localisation et l’activité de l’ADN de transfert (T-DNA) une fois injecté dans les cellules racinaires par la bactérie Agrobacterium tumefaciens. Nous travaillons avec des souches sauvages (C58) et virulentes qui induisent la formation de tumeurs chez de nombreuses espèces végétales in natura, en utilisant A. thaliana comme modèle d’étude.

Personnels impliqués : Myrtille Barrot (doctorante, 2025-2028) et Frédéric Pontvianne (CNRS DR2)

Collaborateurs : Denis Faure (I2BC, Saclay) et Angélique Délèris (I2BC, Saclay)

Financements : ANR Mobil-DNA (ANR-24-CE20-6240-03 ; 2024-2028) et Co-financement de ma thèse par l’EUR TULIP

2. Imagerie en temps réel d’un élément transposable actif (ONSEN)

Nous développons des méthodologies innovantes en microscopie pour suivre l’intégralité du cycle de vie de l’élément rétro-transposable ONSEN, activé sous stress thermique, afin d’explorer sa dynamique avec une résolution à l’échelle de la cellule unique. Notre système permet également de détecter les ADN circulaires extra-chromosomiques (EccDNA) générés lors de l’activation d’ONSEN et qui s’accumulent dans la cellule.

Personnels impliqués : Petra Barnas (doctorante MSCA-DN, 2026-2029), Aurore Sureau (CNRS IE CDD), Myrtille Barrot (doctorante, 2025-2028), Frédéric Pontvianne (CNRS DR2) et Franziska Buslaps (European Project Manager, CNRS IE CDD)

Collaborateurs : MSCA-DN AGILE Consortium, Mathieu Ingouff (IRD, Montpellier) et Marie Mirouze (IRD, LGDP, Perpignan)

Financement : MSCA-DN AGILE (n° de convention 101226536 ; 2026-2030)