Le plateau de culture cellulaire est réparti sur deux étages et organisé en quatre laboratoires L2, regroupés deux par deux chacun autour d'un sas commun (agrément L2-0457 du 25/04/2023, pour cinq ans). Un des laboratoires est évolutif en L3 si besoin dans le futur.
Différents types de culture sont réalisés : lignées cellulaires (cellules souches, lignées normales immortalisées ou tumorales) et tissus (embryons, cultures primaires) provenant de différentes espèces (souris, homme, drosophile), et différentes techniques sont maîtrisées : modification génique (lipofection, électroporation, transduction lentivirale...), différenciations cellulaires, création de modèles cellulaires pour la recherche.
La plateforme cellule unique se répartit sur deux étages et comprend plusieurs équipements de pointe permettant le contrôle qualité, l'analyse phénotypique, l'isolement, et la caractérisation d'un faible nombre de cellules voire de cellule unique. Il s'agit par exemple de l'isolement et de la caractérisation phénotypique de cellules rares dans un tissu dissocié, de l'isolement de cellules uniques pour des expériences CRISPR, de l'analyse transcriptomique en utilisant les équipements Chromium (10X genomics) ou Rhapsody (BD bioscience) sur cellule unique.
Différents types de culture sont réalisés : lignées cellulaires (cellules souches, lignées normales immortalisées ou tumorales) et tissus (embryons, cultures primaires) provenant de différentes espèces (souris, homme, drosophile), et différentes techniques sont maîtrisées : modification génique (lipofection, électroporation, transduction lentivirale...), différenciations cellulaires, création de modèles cellulaires pour la recherche.
La plateforme cellule unique se répartit sur deux étages et comprend plusieurs équipements de pointe permettant le contrôle qualité, l'analyse phénotypique, l'isolement, et la caractérisation d'un faible nombre de cellules voire de cellule unique. Il s'agit par exemple de l'isolement et de la caractérisation phénotypique de cellules rares dans un tissu dissocié, de l'isolement de cellules uniques pour des expériences CRISPR, de l'analyse transcriptomique en utilisant les équipements Chromium (10X genomics) ou Rhapsody (BD bioscience) sur cellule unique.
Missions
Equipement et expertise :
a) Cultures tissulaire et cellulaire (Céline Gonthier Gueret):
- 8 PSM de type II
- 10 incubateurs CO2
- 5 microscopes inversés (dont 3 équipés en fluorescence)
- matériel classique (centrifugeuses, bains-marie…)
b) Equipements pour analyse d’un faible nombre de cellules voire cellule unique (Stéphanie Maupetit-Méhouas, Nicolas Allègre):
Plateforme virtuelle, différents instruments sont disponibles au sein de l’iGReD et sur le campus de Clermont ferrand (Cezeaux)
- 1 FACS Melody (BD Biosciences), isolement de cellule unique (en tube, plaque ou lame)
- 5 ROCHE Light Cyclers (Roche)
- 1 Rhapsody (BD Bioscience), analyse transcriptomique (mRNAseq) sur cellule ou noyau unique
- 1 Chromium (10X genomics), analyse transcriptomique (mRNAseq) et accéssibilité chromatine (ATACseq) sur cellule ou noyau unique.
- 1 TapeStation (Agilent), evaluation de la qualité des ARNs et ADNs
- 1 ATTUNE Cytometer (Life Technologies)
- 2 micromanipulateurs pour microinjection (Eppendorf) (partagé avec la plateforme Transgenese souris – Cézeaux)
