Christophe TATOUT

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TATOUT
Christophe
Chef d'équipe
PU

Présentation

2021-: Responsable du Master de Bio-informatics

2017-2021: Coordinateur du projet Européen COST-Action CA16212

2013: Professeur de Génétique et d'Epigénétique, co-responsable de l'équipe 3 (GReD)
2009: Professeur de Génétique et d'Epigénétique, Université Blaise Pascal, membre de l'équipe du Dr Sylvette Tourmente (GReD)
1999-2009: Maize genetics and genomics team at Biogemma, Chappes.
2005: Habilitation à Diriger des Recherches (HDR)
1997-1999:  Postdoc, UMR CNRS 6457, Equipe Pr  Jean-Marc Deragon
1994-1997: Postdoc, Department of Zoology and Animal Biology, Geneva, Equipe Dr Vincenzo Pirrotta
1990-1993: PhD, URA360, Blaise Pascal University, France, Equipe Pr Hubert Pinon

Recherche

Role of the nuclear periphery in chromatin organization

Discover how and why the spatial organization of chromatin impacts gene expression https://www.youtube.com/watch?v=lK_5EhFux0s

Selected reviews : Tatout et al, Chromosome Res, 2014, and Parry et al, J. Cell Science, 2018) and research articles (Graumann et al, J. Exp. Bot., 2014, and Pawar et al 2016

Publications

40 publications
2022

Image analysis workflows to reveal the spatial organization of cell nuclei and chromosomes.

Publié le 30 Déc 2022 dans Nucleus (Austin, Tex.) , vol. 13 - pp 277-299

Randall RS, Jourdain C, Nowicka A, Kaduchová K, Kubová M, Ayoub MA, Schubert V, Tatout C , Colas I, Kalyanikrishna, Desset S , Mermet S , Boulaflous-Stevens A, Kubalová I, Mandáková T, Heckmann S, Lysak MA, Panatta M, Santoro R, Schubert D, Pecinka A, Routh D, Baroux C

Deep learning — promises for 3D nuclear imaging: a guide for biologists.

Publié le 01 Avr 2022 dans Journal of cell science , vol. 135

Mougeot G , Dubos T , Chausse F, Péry E, Graumann K, Tatout C , Evans DE, Desset S

2021

The Histone Chaperone HIRA Is a Positive Regulator of Seed Germination.

Publié le 14 Avr 2021 dans International journal of molecular sciences , vol. 22

Layat E , Bourcy M, Cotterell S , Zdzieszyńska J, Desset S , Duc C , Tatout C , Bailly C, Probst AV

2020

Automated 3D bio-imaging analysis of nuclear organization by NucleusJ 2.0.

Publié le 30 Déc 2020 dans Nucleus (Austin, Tex.) , vol. 11 - pp 315-329

Dubos T , Poulet A , Gonthier-Gueret C, Mougeot G , Vanrobays E , Li Y , Tutois S , Pery E, Chausse F, Probst AV, Tatout C , Desset S

Untangling chromatin interactions.

Publié le 17 Août 2020 dans Journal of experimental botany , vol. 71 - pp 5115-5118

Parry G, Pradillo M, Probst AV , Tatout C

The H3 histone chaperone NASP(SIM3) escorts CenH3 in Arabidopsis.

Publié le 30 Jan 2020 dans The Plant journal : for cell and molecular biology , vol. 101 - pp 71-86

Le Goff S , Keçeli BN, Jeřábková H, Heckmann S, Rutten T, Cotterell S , Schubert V, Roitinger E, Mechtler K, Franklin FCH, Tatout C , Houben A, Geelen D, Probst AV , Lermontova I

2019

Probing the 3D architecture of the plant nucleus with microscopy approaches: challenges and solutions.

Publié le 30 Déc 2019 dans Nucleus (Austin, Tex.) , vol. 10 - pp 181-212

Dumur T, Duncan S, Graumann K, Desset S , Randall RS, Scheid OM, Prodanov D, Tatout C , Baroux C

2018

Computational Methods for Studying the Plant Nucleus.

Publié le 01 Jan 2018 dans Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) , vol. 1840 - pp 205-219

Poulet A , Zhou X, Tamura K, Meier I, Tatout C , Graumann K, Evans DE

Investigation of Nuclear Periphery Protein Interactions in Plants Using the Membrane Yeast Two-Hybrid (MbY2H) System.

Publié le 01 Jan 2018 dans Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) , vol. 1840 - pp 221-235

Voisin M , Vanrobays E , Tatout C

Quantitative 3D Analysis of Nuclear Morphology and Heterochromatin Organization from Whole-Mount Plant Tissue Using NucleusJ.

Publié le 01 Jan 2018 dans Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) , vol. 1675 - pp 615-632

Desset S , Poulet A , Tatout C

Genetic and epigenetic variation in 5S ribosomal RNA genes reveals genome dynamics in Arabidopsis thaliana.

Publié le 06 Avr 2018 dans Nucleic acids research , vol. 46 - pp 3019-3033

Simon L , Rabanal FA, Dubos T , Oliver C, Lauber D , Poulet A , Vogt A, Mandlbauer A, Le Goff S , Sommer A, Duborjal H, Tatout C , Probst AV

Spatial organization of chromosome territories in the interphase nucleus of trisomy 21 cells.

Publié le 30 Juin 2018 dans Chromosoma , vol. 127 - pp 247-259

Kemeny S, Tatout C , Salaun G, Pebrel-Richard C, Goumy C, Ollier N, Maurin E, Pereira B, Vago P, Gouas L

Meeting report – INDEPTH kick-off meeting.

Publié le 25 Juin 2018 dans Journal of cell science , vol. 131

Parry G, Probst AV, Baroux C, Tatout C

2017

Arabidopsis ATRX Modulates H3.3 Occupancy and Fine-Tunes Gene Expression.

Publié le 30 Juil 2017 dans The Plant cell , vol. 29 - pp 1773-1793

Duc C , Benoit M , Détourné G , Simon L , Poulet A , Jung M, Veluchamy A, Latrasse D, Le Goff S , Cotterell S , Tatout C , Benhamed M, Probst AV

Exploring the evolution of the proteins of the plant nuclear envelope.

Publié le 02 Jan 2017 dans Nucleus (Austin, Tex.) , vol. 8 - pp 46-59

Poulet A , Probst AV, Graumann K, Tatout C , Evans D

2016

A novel family of plant nuclear envelope-associated proteins.

Publié le 30 Oct 2016 dans Journal of experimental botany , vol. 67 - pp 5699-5710

Pawar V, Poulet A , Détourné G , Tatout C , Vanrobays E , Evans DE, Graumann K

2015

Marker gene tethering by nucleoporins affects gene expression in plants.

Publié le 01 Jan 2015 dans Nucleus (Austin, Tex.) , vol. 6 - pp 471-8

Smith S, Galinha C, Desset S , Tolmie F, Evans D, Tatout C , Graumann K

NucleusJ: an ImageJ plugin for quantifying 3D images of interphase nuclei.

Publié le 01 Avr 2015 dans Bioinformatics (Oxford, England) , vol. 31 - pp 1144-6

Poulet A , Arganda-Carreras I, Legland D, Probst AV, Andrey P, Tatout C

2014

The plant LINC complex at the nuclear envelope.

Publié le 30 Juin 2014 dans Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology , vol. 22 - pp 241-52

Tatout C , Evans DE, Vanrobays E , Probst AV, Graumann K

Characterization of two distinct subfamilies of SUN-domain proteins in Arabidopsis and their interactions with the novel KASH-domain protein AtTIK.

Publié le 30 Déc 2014 dans Journal of experimental botany , vol. 65 - pp 6499-512

Graumann K, Vanrobays E , Tutois S , Probst AV, Evans DE, Tatout C

Evolutionary history of Methyltransferase 1 genes in hexaploid wheat.

Publié le 23 Oct 2014 dans BMC genomics , vol. 15 - pp 922

Thomas M, Pingault L, Poulet A , Duarte J, Throude M, Faure S, Pichon JP, Paux E, Probst AV, Tatout C

2011

Characterization of a cinnamoyl-CoA reductase 1 (CCR1) mutant in maize: effects on lignification, fibre development, and global gene expression.

Publié le 30 Juil 2011 dans Journal of experimental botany , vol. 62 - pp 3837-48

Tamasloukht B, Wong Quai Lam MS, Martinez Y, Tozo K, Barbier O, Jourda C, Jauneau A, Borderies G, Balzergue S, Renou JP, Huguet S, Martinant JP, Tatout C , Lapierre C, Barrière Y, Goffner D, Pichon M

2007

empty pericarp4 encodes a mitochondrion-targeted pentatricopeptide repeat protein necessary for seed development and plant growth in maize.

Publié le 30 Jan 2007 dans The Plant cell , vol. 19 - pp 196-210

Gutiérrez-Marcos JF, Dal Prà M, Giulini A, Costa LM, Gavazzi G, Cordelier S, Sellam O, Tatout C , Paul W, Perez P, Dickinson HG, Consonni G

2006

Two cytosolic glutamine synthetase isoforms of maize are specifically involved in the control of grain production.

Publié le 30 Nov 2006 dans The Plant cell , vol. 18 - pp 3252-74

Martin A, Lee J, Kichey T, Gerentes D, Zivy M, Tatout C , Dubois F, Balliau T, Valot B, Davanture M, Tercé-Laforgue T, Quilleré I, Coque M, Gallais A, Gonzalez-Moro MB, Bethencourt L, Habash DZ, Lea PJ, Charcosset A, Perez P, Murigneux A , Sakakibara H, Edwards KJ, Hirel B

2005

UDP-glucose dehydrogenases of maize: a role in cell wall pentose biosynthesis.

Publié le 15 Oct 2005 dans The Biochemical journal , vol. 391 - pp 409-15

Kärkönen A, Murigneux A , Martinant JP, Pepey E, Tatout C , Dudley BJ, Fry SC

2002

Extensive conservation of sequences and chromatin structures in the bxd polycomb response element among Drosophilid species.

Publié le 30 Jan 2002 dans The International journal of developmental biology , vol. 46 - pp 133-41

Dellino GI, Tatout C , Pirrotta V

2001

Target sites for SINE integration in Brassica genomes display nuclear matrix binding activity.

Publié le 01 Jan 2001 dans Chromosome research : an international journal on the molecular, supramolecular and evolutionary aspects of chromosome biology , vol. 9 - pp 325-37

Tikhonov AP, Lavie L, Tatout C , Bennetzen JL, Avramova Z, Deragon JM

2000

Structure of a polycomb response element and in vitro binding of polycomb group complexes containing GAGA factor.

Publié le 30 Mai 2000 dans Molecular and cellular biology , vol. 20 - pp 3187-97

Horard B, Tatout C , Poux S, Pirrotta V

P-element transposition in Drosophila melanogaster: influence of size and arrangement in pairs.

Publié le 30 Avr 2000 dans Molecular & general genetics : MGG , vol. 263 - pp 445-54

Delattre M, Tatout C , Coen D

Artificial and epigenetic regulation of the I factor, a nonviral retrotransposon of Drosophila melanogaster.

Publié le 30 Déc 2000 dans Genetics , vol. 156 - pp 1867-78

Gauthier E, Tatout C , Pinon H

1998

Similar target site selection occurs in integration of plant and mammalian retroposons.

Publié le 30 Oct 1998 dans Journal of molecular evolution , vol. 47 - pp 463-70

Tatout C , Lavie L, Deragon JM

Rapid evaluation in Escherichia coli of antisense RNAs and ribozymes.

Publié le 30 Nov 1998 dans Letters in applied microbiology , vol. 27 - pp 297-301

Tatout C , Gauthier E, Pinon H

1994

Germ-line expression of a functional LINE from Drosophila melanogaster: fine characterization allows for potential investigations of trans-regulators.

Publié le 30 Mar 1994 dans The International journal of developmental biology , vol. 38 - pp 27-33

Tatout C , Docquier M, Lachaume P, Mesure M, Lécher P, Pinon H

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